…in glycosylation is a key prerequisite for the understanding of complex biological processes and medical applications. This project focuses on the study of the reaction mechanism of a glycosyltransferase with the use of state-of-the-art QM/MM molecular dynamics methods. Employing the quantum chemistry methods allows us to study the reaction mechanism and find the transition state with high precision.
…to energies exceeding a few GeVs, suitable for many applications. The main laser pulse interaction with almost instantaneously ionized targets occurs during several tens of femtoseconds and experimental measurements cannot well resolve all processes during such short time interval. Thus, numerical simulations are indispensable tool for this scientific research. However, such simulations in real 3D geometry,…
…screen a large number of compounds). In this project, we will explore whether density functional theory, which is a much more efficient method typically including empirical parameters, can be used in place of the aforementioned expensive methods to describe 1D and 2D systems. This will be done by applying the concept of nonempirical tuning, developed for describing molecules, to 1D and 2D periodic systems.
…by lung surfactant deficiency. The treatment relies on Surfactant Replacement Therapy, which is mostly linked with mechanical ventilation and intubating that provides breathing support to infants. However the mechanical ventilation is a costly treatment and invasive. Therefore new surfactant administration is seeking that however requires a good knowledge on the flow field and aerosol transport and…
…excited states. Therefore, the use of quantum chemical – molecular mechanical methods (QM/MM) with QM part described by time-dependent DFT (TD-DFT) technique is necessary. With our recently utilized QM/MM/MD approach [Takematsu ] we will investigate the electron transfer properties for different redox pathways of experimentally studied blue copper protein mutants with attached Re photosensitizer. Relaxation from…
…as shape-selective catalysts. Increasingly, attention has focused on fine-tuning the properties of zeolite catalysts in order to carry out very specific syntheses of high-value chemicals. Periodic DFT methods permit investigations of properties of zeolite-based catalysts which are needed for their fine-tuning. DFT calculations are complementary to experimental examinations and together they can provide more…
…závodní stravování v menze, MultiSport karta a další benefity. Přihlášky doložené životopisem a motivačním dopisem zasílejte na mailovou adresu petra.brozova@vsb.cz do 22. 4. 2024. Do předmětu zprávy uvádějte prosím „VŘ na pozici Specialista/ka pro eventy a komunikaci“. Osobní údaje uchazeče budou zpracovány v rozsahu nezbytném pro realizaci výběrového řízení v souladu s Nařízením EU 2016/679. https://www.vsb.cz/export/sites/vsb/cs/.content/galerie-souboru/Informace-pro-uchazece-o-zamestnani.pdf
…types of graphene-TM carbide/nitride heterostructure with different interface spacing and with different thickness of graphene layer; 2) ab initio derived ideal strength and Peierls stress of graphene-TM carbide/nitride heterostructure, and the corresponding mechanism, e.g., Friedel oscillations, electronic structure instabilities, etc. that are responsible for these upper limits of strength and stress.
…scientific community and semiconductor industry, making them usable in many applications such as active-matrix organic light-emitting diodes (OLEDs) in smartphones, organic field-effect transistors (OFETs), solar cells, memories, photoswitches and sensors. In such Hlavní řešitel: Jan Hečko Projekt: SOLPS-ITER simulations of discharges with seeding in the COMPASS tokamak Alokace: Barbora CPU 4000, Barbora…
…150 000 jádrohodin Abstrakt: The project is focused on numerical modeling of flow around objects in the atmospheric boundary layer. This issue is complicated mainly due to the atmospheric turbulence, which requires the use of advanced numerical models of the flow coupled with detailed computational mesh of the domain. This research will contribute to bigger efficiency in design of building structures.
…along the axis of rotation of the black hole accelerates the gas away from the center up to relativistic speed. On the other hand, the density waves caused by the motion of the star in the medium are spreading both downwards and outwards and hence influence the accretion rate on the black hole and the density distribution in the disc. To see the complicated structure of the outflow and inflow, robust 3D…
…and phonon modes for control of magnetism. Řešitel: Eugen Hruska OPEN-30-9 Predicting drug candidate metabolism Karolina CPU Alloc=478; Karolina GPU Alloc=300 Drug metabolism estimation plays a vital role during the development of pharmaceutically active compounds. To improve the reliability of computational drug metabolism prediction, high-throughput physics-driven ab initio calculations will be performed.
…CFD. However this engineering approach doesn´t elucidate the role of individual elements of the RPB and their contribution to CO2 capture. Moreover there is no relevant literature that illuminates the abovementioned mechanisms in context, and which studies in detail the interaction between liquid distribution and the efficiency of gas capture. Therefore the main goal of this project is to consider the RPB…
…laying bases for utilizing vast amounts of readily available data online but which come without careful annotations. However, we can often obtain some metadata along with it. We will demonstrate the developed methods on the full (uncut) VoxCeleb recordings for which we know the names of the celebrities appearing on each video without knowledge of the time intervals the celebrities appear in the video.…
…projektu: CZ.02.2.69/0.0/0.0/18_053/0016985 Projekt Věda bez hranic 2.0 umožní realizaci 26 mezinárodních mobilit výzkumných pracovníků, ze zahraničí do ČR i z ČR do zahraničí. Podpoří tak ne zcela dostatečnou úroveň mezinárodní spolupráce ve výzkumu a profesní růst lidských zdrojů ve výzkumu. Výzkumní pracovníci se budou rozvíjet ve svých oborech výzkumu, své poznatky přenesou na pracoviště a do výzkumných týmů…
…přiřazena hodnocení dosažených výsledků předcházejících projektů IT4I registrovaných na https://scs.it4i.cz/publications. V průměru očekáváme 1 dosažený výsledek na projekt. Toto bude aplikováno na všechny projekty starší 15 měsíců. Uchazeč bude o výsledku soutěže vyrozuměn do 35 pracovních dní od uzavření soutěže. Vyrozumění proběhne elektronicky, na e-mailovou adresu uvedenou v žádosti. Povinné poděkování u…
…přiřazení e-INFRA CZ k výsledkům VaV při exportu do RIV vizte POVINNOSTI UŽIVATELE. Termín vyhlášení další Veřejné grantové soutěže: červen 2024 multi-year přístupy O projekty si můžete zažádat také formou „multi-year“ přístupů, v rámci kterých jsou výpočetní prostředky poskytovány po dobu 24 nebo 36 měsíců. Účelem je podporovat dlouhodobé vědecké granty. Více o multi-year přístupu výsledky soutěží
…Processing (NLP). These highly sophisticated models benefit from the combination of a huge amount of unlabeled text data available on the Internet, self-supervised training methods motivated by learning skills of a human brain and still increasing computational power of high-end GPU and TPU clusters.The main idea behind text-based Transformers is to let the model read as much text as possible during the…
…a rural one (NOURBAN). Besides, we also used three different options for the microphysics and convective schemes. We expect to show that the inclusion of urban canopy schemes leads to an increase in temperature and a decrease in wind speed as well as to changes in other relevant meteorological values such as cloudiness and precipitation, which also depend on the microphysics and convective scheme used.
…Vývoj knihovny BEM4I Výzva: 9. Veřejná grantová soutěž Hlavní řešitel: Michal Merta Instituce: IT4Innovations Oblast: Informatika Vědci z IT4Innovations pokračují ve vývoji knihovny paralelních řešičů založených na metodě hraničních prvků (BEM). V rámci předchozího projektu byla tato knihovna (BEM4I) akcelerována pomocí koprocesorů Intel Xeon Phi (Knights Corner, KNC), což doplnilo již existující a funkční…
…(dokování a skórování) k identifikování vhodných látek pro vývoj nových léčiv a je prakticky využíván farmaceutickým průmyslem. Kvůli vysokým požadavkům na rychlost výpočtů je však stále spolehlivost těchto metod nízká. S pomocí našich supervýkonných počítačů dokáží vědci z týmu prof. Hobzy předvídat pomocí přesných kvantově-chemických výpočtů jak strukturu léku v aktivním místě proteinů tak i jejich…
…odpovídajících na otázku: „Co se stane, když...?“ Systém aktuálně integruje: hydrologické modelování sledování aktuální dopravní situace modelování úniku nebezpečných látek monitorování mobility obyvatel https://floreon.vsb.cz Analýzy biologických obrazů Jsme zapojeni do výzkumu zpracování rozsáhlých biologických dat pomocí vysokovýkonných výpočetních systémů (HPC). Výzkum je zaměřen na paralelizaci zpracování…
…a Transportation Research Arena 2018 konaná ve Vídni. https://web.fe.up.pt/~specs/projects/antarex/ Slovo partnera Radim Cmar Sygic, a.s. “Spolupráce s IT4Innovations a využívání jejich zkušeností a zdrojů v oblasti superpočítačů a modelování dopravy rozšiřuje naše schopnosti a poskytuje analýzu dopravy pro města ve velkém měřítku a téměř v reálném čase, což činí na dnešním trhu náš produkt velmi konkurenceschopným.”
